Identificación de once candidatos vacunales potenciales contra la malaria por medio de la Bioinformática
Resumen
En este trabajo se propusieron once candidatos vacunales potenciales contra el Plasmodium falciparum, causante de la muerte de entre 2 y 3 millones de personas cada año. Los candidatos vacunales se seleccionaron mediante una búsqueda de fragmentos del genoma de P. falciparum que presentaban una clara evidencia antigénica y que, a su vez, están expresadas en cuatro estadios del ciclo de vida del parásito: esporozoito, merozoito, trofozoito y gametocito. Los candidatos finales, elegidos in silico con ayuda de las herramientas de la Bioinformática, son aquellos fragmentos ya secuenciados y contenidos en la base de datos PlasmoDB. Los identificadores de los candidatos son: PFC0975c, PFE0660c, PF08_0071, PF10_0084, PFI0180w, MAL13P1.56, PF14_0192, PF13_0141, PF14_0425, PF13_0322 y PF14_0598.Citas
Organización Panamericana de la Salud. Population Living in Malaria-Endemic Areas in the Americas 1994-2007. Disponible en: http://www.paho.org/English/AD/DPC/CD/mal-americas-2007.pdf . [Consultado: 19 Junio de 2008].
Nabarro DN, Tayler EM. The roll back malaria campaign. Science 1998;280:2067-8.
UNICEF. El Paludismo. Disponible en: http://www.unicef.org/spanish/health/index_malaria.html [Consultado: 29 de septiembre de 2009].
Sacarlal J, Aide P, Aponte JJ, Renom M, Leach A, Mandomando I, et al. Long-Term Safety and Efficacy of the RTS.S/AS02A. Malaria Vaccine in Mozambican Children. J Infect Dis 2009; 200:329-36.
Loria P, Miller S, Foley M, Tilley L. Inhibition of the peroxidative degradation of haem as the basis of action of chloroquine and other quinoline antimalarials. Biochem J 1999; 339: 363-70.
Astro-Sancho J, Munguia-Ramírez M, Avila-Agüero M. Malaria: una actualización. Acta Méd Costarric 2002; 44:107-12.
Prieto JH, Koncarevic S, Park SK, Yates JR, Becker K. Large-Scale Differential Proteome Analysis in Plasmodium falciparum under Drug Treatment. PLoS ONE 2008; 3(12):e4098. doi:10.1371/journal.pone.0004098.
Gardner MJ, Hall N, Fung E, White O, Berriman M, Hyman RW, et al. Genome sequence of the human malaria parasite Plasmodium falciparum. Nature 2002; 419: 498-511.
Kasam V, Salzemann J, Botha M, Dacosta A, Degliesposti G, Isea R, et al. WISDOM-II: Screening against multiple targets implicated in malaria using computational grid infrastructures. Malaria J 2009;8:88. doi:10.1186/1475-2875-8-88.
Kolaskar AS, Tongaonkar P. A semi-empirical method for prediction of antigenic determinants on protein antigens. FEBS Lett 1990; 276:172-4.
Emini EA, Hughes JV, Perlow DS, Boger J. Induction of hepatitis A virus-neutralizing antibody by a virus-specific synthetic peptide. J Virol 1985; 55:836-9.
Wheeler DL, Barrett T, Benson DA, Bryant SH, Canese K, Chetvernin V, et al. Database resources of the National Center for Biotechnology Information. Nucleic Acids Res 2006; 34:D173-D180.
Aparicio G, Blanco F, Blanquer I, Bonavides C, Chaves JL, Embid M, et al. Developing Biomedical Applications in the framework of EELA. In: Udoh E, Wang FZ, eds. Handbook of Research on Grid Technologies and Utility Computing: Concepts for Managing Large-Scale Applications. Hersey: Editorial IGI Global; 2009. p. 206-18.
Chiu JC, Lee EK, Egan MG, Sarkar IN, Coruzzi GM, DeSalle R. Ortholog ID automation of genome-scale ortholog identification within a parsimony framework. Bioinformatics 2006; 22:699-707.
Moller S, Croning MDR, Apweiler R. Evaluation of methods for the prediction of membrane spanning regions. Bioinformatics 2001;17:646-53.
Aurrecoechea C, Brestelli J, Brunk BP, Dommer J, Fischer S, Gajria B, et al. PlasmoDB: a functional genomic database for malaria parasites. Nucleic Acids Res 2009;37:D539-43.
Derechos de autor 2016 Raúl Isea
Esta obra está bajo licencia internacional Creative Commons Reconocimiento-NoComercial-CompartirIgual 4.0.
VacciMonitor es una revista de libre acceso, bajo licencia Creative Commons. La revista permite reutilizar su contenido acorde a: https:/creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.es.
Concede a los autores los permisos siguientes:
-Tener la propiedad total del copyright sin restricciones.
-Distribuir copias, electrónicas o impresas, del artículo publicado entre sus estudiantes o colegas, así como permiso para que los demás miembros de su institución las utilicen con propósitos de enseñanza.
-Reutilizar parte o la totalidad del artículo en nuevos manuscritos o libros futuros.
-VacciMonitor no pone reparos en que el autor coloque su versión, o la editada por la revista, en su sitio web personal o en un repositorio de acceso abierto.
-VacciMonitor autoriza a otras casas editoriales o bases de datos a reproducir los materiales originales publicados en ella, siempre que se indique su procedencia.
