La mutación N15Y en la proteína E del coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo afecta la unión de doxiciclina y rutina
Resumen
La variación genética del coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo debe ser monitoreada de cerca. La transmisión viral puede resultar inevitablemente de mutaciones en el genoma viral y proteínas funcionales que ayudan en la adaptación del virus al hospedero. Este estudio tuvo como objetivo buscar mutaciones en la proteína E y ver cómo afectaban el acoplamiento molecular de los ligandos. Se utilizó la mutagénesis de saturación matemática y otras técnicas informáticas. Se seleccionaron 14 aislamientos del coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo en Irak. Se eligieron doxiciclina y rutina como ligandos. En cuatro cepas del coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo, se detectó la mutación N15Y en la proteína de la envoltura. Dependiendo del cálculo de la cantidad de energía de los átomos, esta mutación es fundamental para modificar la forma de la proteína y aumentar la estabilidad de la proteína. En la mutación de cadena única, se determinó un bolsillo, mientras que todas las cadenas de pentámero tenían dos bolsillos. La mutación N15Y alteró el grado de unión de doxiciclina al afectar el residuo de unión de los ligandos. También alteró la posición de unión de la rutina a la proteína E, lo que tiene un claro impacto en la partícula del virión.Derechos de autor 2022 Ali Adel Dawood, Bassam Ismael Jasim, Omar Al-jalily
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